由于人類種族、性別、地域、所處地理環境等不同，使得人們抵抗外界刺激侵襲的能力也不相同，因此對內毒素的反應也存在著個體差異。以下幾種因素影響宿主對內毒素的反應。

1、殺菌性/穿透性增強蛋白（BPI），來自中性粒細胞，通過與血清脂多糖結合蛋白（LBP）競爭性結合脂多糖，抵消內毒素在循環中的毒性作用。

2、抗脂多糖抗體（IgM）結合并滅活那些宿主已接觸過的異性脂多糖。

3、高密度脂蛋白（HDL）代謝并清除脂多糖。

4、脂多糖結合蛋白運送脂多糖到炎癥部位，在此啟動炎癥細胞因子反應，在任何部位中，脂多糖結合蛋白的數量決定了反應的程度。例如，在一個膿腫部位，中性粒細胞數量占優勢，此部位的殺菌性/穿透性增強蛋白的比例高于脂多糖結合蛋白，因此在這一部位釋放的脂多糖會被中和。相反，如果脂多糖釋放入關節、腦脊液或腹膜液，則更可能與脂多糖結合蛋白而不是和殺菌性/穿透性增強蛋白相互作用，因此激活炎癥細胞因子系統。

5、宿主腫瘤壞死因子（TNF）的產生依賴于遺傳因素，調節腫瘤壞死因子產生的等位基因純合子會產生高水平的腫瘤壞死因子。所以在這些個體中，敗血癥往往是更加致命的。